
最初的化學(xué)反應(yīng)在生命起源時(shí)是如何開始的?它們的能量來源是什么?海因里?!ずD髮W(xué)Düsseldorf (HHU)的研究人員重建了人類最后一個(gè)共同祖先LUCA的新陳代謝。他們發(fā)現(xiàn),原始生命用來拼湊細(xì)胞分子構(gòu)件的幾乎所有化學(xué)步驟都是能量釋放反應(yīng)。這確定了驅(qū)使這些反應(yīng)向前發(fā)展的長期尋求的能量來源,而這些能量一直隱藏在人們的眼皮底下。合成生命基石所需的能量來自新陳代謝本身,只要包含一種基本的起始化合物。在生命起源時(shí),從內(nèi)部釋放能量的秘密成分是所有能源載體中最清潔、最綠色、最新和最古老的:氫氣,H2。
哈佛大學(xué)分子進(jìn)化研究所的威廉·馬丁教授的團(tuán)隊(duì)研究了早期地球上生命是如何以及在哪里產(chǎn)生的。他們的方法是實(shí)驗(yàn)性和計(jì)算性的。在實(shí)驗(yàn)室里,他們利用海底熱液噴口中發(fā)現(xiàn)的催化劑和條件,進(jìn)行化學(xué)實(shí)驗(yàn),研究氫和二氧化碳之間的反應(yīng)。在計(jì)算機(jī)上,他們開發(fā)了一種分子考古學(xué)的形式,使他們能夠發(fā)現(xiàn)保存在蛋白質(zhì)、DNA和現(xiàn)代細(xì)胞化學(xué)反應(yīng)中的許多不同的原始生命的痕跡。
在他們最新的工作中,他們研究了什么樣的化學(xué)環(huán)境促進(jìn)了產(chǎn)生新陳代謝和后來產(chǎn)生盧卡本身的化學(xué)反應(yīng),以及驅(qū)動(dòng)這些反應(yīng)的能量從何而來。為此,他們沒有研究基因,而是研究了生命自身化學(xué)反應(yīng)所包含的信息。他們確定了402種代謝反應(yīng),這些反應(yīng)自大約40億年前生命起源以來幾乎沒有改變。因?yàn)檫@些反應(yīng)在所有細(xì)胞中都是常見的,所以它們在盧卡中也存在。它們揭示了原始生命在新陳代謝中是如何處理能量的,以及它們從哪里獲得了使生命的化學(xué)反應(yīng)繼續(xù)進(jìn)行所需的能量。
Jessica Wimmer是該研究所的一名博士生,也是這篇新論文的主要作者,她對(duì)LUCA代謝反應(yīng)的能量平衡特別感興趣,因?yàn)樗械纳夹枰芰俊?02年,她做了一個(gè)目錄的反應(yīng)之間的簡單和古代現(xiàn)代細(xì)胞——細(xì)菌和古生菌——用來構(gòu)建生命的基石:20種氨基酸,DNA和RNA的基地,和18維生素(代數(shù)余子式)新陳代謝所必需的。在最原始的現(xiàn)代細(xì)胞中,在Wimmer的計(jì)算機(jī)分析中,這些化合物是由現(xiàn)代環(huán)境中存在的簡單分子合成的,這些分子也存在于早期地球的熱液噴口中:氫(H2)、二氧化碳(CO2)和氨(NH3)。結(jié)果得到了LUCA的代謝網(wǎng)絡(luò)。
當(dāng)被問及這項(xiàng)新研究的核心問題背后的動(dòng)機(jī)時(shí),杰西卡·威默說:“我們想知道推動(dòng)原始新陳代謝的能量來自哪里。大約40億年前,在代謝反應(yīng)開始的時(shí)候,還沒有蛋白質(zhì)或酶來催化反應(yīng),因?yàn)樗鼈冞€沒有進(jìn)化。代謝必然來自于環(huán)境中可能發(fā)生的反應(yīng),也許是借助無機(jī)催化劑。但不管是否有催化劑,為了繼續(xù)進(jìn)行,反應(yīng)必須釋放能量。這些能量從何而來?關(guān)于代謝能的可能來源,文獻(xiàn)中有很多建議。但從來沒有人研究過新陳代謝本身的反應(yīng)?!睘榱苏业酱x反應(yīng)中的能量來源,研究小組計(jì)算了在每個(gè)反應(yīng)中釋放或消耗的自由能,也稱為吉布斯能。
結(jié)果是:盧卡的新陳代謝不需要外部的能量來源,如紫外線、隕石撞擊、火山爆發(fā)或放射性。相反,在許多現(xiàn)代海底熱液噴口的典型環(huán)境中,新陳代謝反應(yīng)向前進(jìn)行所需的能量來自新陳代謝本身。換句話說,幾乎盧卡所有的代謝反應(yīng)都是靠自身釋放能量:生命所需的能量來自生命本身。該研究的資深作者馬丁說:“這令人興奮,因?yàn)橹醒胄玛惔x的400個(gè)相互關(guān)聯(lián)的反應(yīng),乍一看似乎復(fù)雜得令人絕望,但突然顯示出一種自然趨勢,在合適的條件下,它們會(huì)自行展開。”
為了得出這個(gè)結(jié)論,研究小組必須首先使用模擬不同環(huán)境條件的計(jì)算機(jī)程序研究402個(gè)反應(yīng)的能量學(xué),以便區(qū)分能量有利和不利的組合。這一點(diǎn)很重要,因?yàn)榉磻?yīng)是否釋放能量通常取決于環(huán)境條件。他們調(diào)查的條件范圍從pH 1(酸性)到pH 14(堿性),溫度從25到100°C,以及不同的反應(yīng)物相對(duì)數(shù)量的產(chǎn)品。他們特別注意氫的能量作用。Wimmer:“沒有氫,什么也不會(huì)發(fā)生,因?yàn)槭紫刃枰獨(dú)鋸亩趸贾形仗歼M(jìn)入新陳代謝?!?/span>
能量上的最佳條件是堿性pH值在pH 9左右,溫度在80°C左右,需要?dú)鋪砉潭–O2。Martin解釋說:“這和我們在失落之城看到的幾乎一模一樣,失落之城是大西洋中部一個(gè)產(chǎn)h2的熱液場。在這樣的環(huán)境中,大約95% - 97%的盧卡代謝反應(yīng)可以自發(fā)進(jìn)行,也就是說,不需要任何其他能量來源。在水熱系統(tǒng)的深海黑暗中,H2是化學(xué)陽光?,F(xiàn)代能源研究利用了氫與生命完全相同的特性。只是生命有40億年的氫技術(shù)經(jīng)驗(yàn),而我們才剛剛開始?!?/span>
Jessica Wimmer補(bǔ)充說:“關(guān)于生命起源時(shí)的能量,我們可以說純化學(xué)能就足夠了。我們不需要陽光,不需要隕石,不需要紫外線:只需要?dú)錃夂投趸迹偌由弦恍┌焙望}。由于我們生物合成網(wǎng)絡(luò)中的化學(xué)反應(yīng)極其保守,我們可以對(duì)產(chǎn)生盧卡的反應(yīng)獲得一些有趣的見解,盡管它生活在40億年前。”
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